Questi i compiti dell'Agenzia, prevista dall'articolo 10 della legge:
- presidio della fase di attuazione delle politiche,
- monitoraggio sistematico degli interventi,
- accompagnamento e supporto delle amministrazioni centrali e regionali titolari degli interventi finanziati dai fondi strutturali e dal Fondo sviluppo e coesione,
- poteri sostitutivi, solo nel caso in cui si verifichino gravi inadempienze o ritardi ingiustificati.
La nuova struttura avrà, inoltre, una rappresentanza delle amministrazioni territoriali.
